Năm 1983, Islam Karimov được bổ nhiệm làm Bộ trưởng Tài chính của Uzbekistan. Từ tháng 6 năm 1989 ông là Bí thư đầu tiên của Đảng Cộng sản Uzbekistan.
Ngày 24 tháng 3 năm 1990 ông được bầu làm Tổng thống nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Uzbekistan.
Ngày 31 tháng 8 năm 1991 ông Karrimov tuyên bố nước Cộng hòa Uzbekistan độc lập.
Ngày 29 tháng 12 1991, trong cuộc tổng tuyển cử toàn quốc, ông Islam Karimov được bầu làm tổng thống của Uzbekistan.
Năm 2000, ông Karrimov được bầu làm người đứng đầu nhà nước trong thời hạn 7 năm.
Ngày 23 tháng 12 năm 2007, ông tái đắc cử chức vụ tổng thống Uzbekistan.
Trong cuộc bầu cử ngày 29 tháng Ba năm 2015, ông được 90,39% cử tri bầu chọn, và ngày 10 tháng Tư năm 2015 ông Karimov lần nữa tuyên thệ nhậm chức tổng thống.
Ngày 28 tháng 8 năm 2016, trong thông báo đưa ra sau khi các phương tiện truyền thông đưa tin ông Karimov đột quỵ, Nội các Uzbekistan cho biết ông Karimov đã phải nhập viện.
Hai mươi bốn giờ sau đó, con gái của ông là Lola Karimova xác nhận trên trang Facebook rằng cha cô bị xuất huyết não và đang được chăm sóc trong tình trạng ổn định.
