Không bao lâu sau việc loại bỏ Bin Laden tháng Năm 2011, các phương tiện truyền thông Mỹ loan báo rằng trong thành công của chiến dịch đặc nhiệm có sự giúp sức đắc lực của Afridi: theo lệnh của CIA, viên bác sĩ đã thâm nhập vào ngôi nhà, nơi giả định là có đầu sỏ "Al-Qaeda"* sinh sống, và với cái cớ hư cấu là tiêm phòng vaccine, ông này đã lấy được mẫu DNA từ các thành viên gia đình trùm khủng bố.
Khi đó người đứng đầu Lầu Năm Góc Leon Panetta và Ngoại trưởng Hillary Clinton công khai thừa nhận đóng góp của Afridi trong việc diệt trừ Bin Laden. Chiến dịch do đặc nhiệm Mỹ tiến hành trong lãnh thổ Pakistan mà không có sự cho phép của chính quyền nước này đã gây phản ứng gay gắt từ phía Islamabad với Washington và làm bùng phát trầm trọng hơn trong quan hệ song phương. Sau đó, theo quyết định của tòa án Pakistan, Afridi bị tống vào tù.
"Vào cuối tháng 12 năm 2017 Văn phòng liên bộ tình báo Pakistan (ISI) từ nguồn riêng của mình đã biết về kế hoạch tẩu thoát của bác sĩ Shakil Afridi ra khỏi nhà tù Peshawar, ngay sau đó kế hoạch này đã bị ISI đập tan", — nguồn tin cho biết.
*Tổ chức khủng bố bị cấm ở Nga
